V roce 1934 nastoupil jako nový farář do Strážnice P. Jan Vrtek. Od svého příchodu považoval za svůj hlavní úkol důkladně opravit farní kostel, který tuto opravu již nutně potřeboval. Koncem září 1939 se začala dělat úplně nová střecha. Do zimy dostal kostel nové krovy i krytinu. Historické prameny uvádí, že na klenbě kostela se našlo i hodně tříště ze staré střechy a opálené kusy dřeva jako pozůstatek požárů ještě ze 17. století. Další práce však byly brzy zastaveny v důsledku okupace a válečných událostí. Uvězněním a úmrtím starosty Františka Stanislava v Osvětimi bylo přerušeno i jednání o státní finanční podpoře na opravu kostela. Teprve v roce 1943 se oprava znovu rozjela, a to z peněz, které vybrali na základě dobrovolné sbírky věřící. Do dvou let byly renovovány všechny oltáře a sochy, byly restaurovány obrazy. Opravy se prováděly pod dohledem Památkového úřadu v Brně a častým hostem byl architekt Madlmeyer. Podél kostela byl zbudován kamenný dlážděný chodník a ve věži byl vybourán starodávný průchod po léta zazděný. U chóru ze severní strany byla přistavěna okrouhlá věžička s novým přístupem na kůr. Tím se uvolnilo místo uvnitř kostela, a proto zde mohly být umístěny nové zpovědnice jako dar od továrníka Jana Graubnera.